Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH3

TUBG2, Tubulin gamma-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG2Q9NRH3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBG2Q9NRH3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBG2Q9NRH3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBG2Q9NRH3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBG2Q9NRH3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBG2Q9NRH3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBG2Q9NRH3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBG2Q9NRH3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBG2Q9NRH3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBG2Q9NRH3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBG2Q9NRH3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBG2Q9NRH3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBG2Q9NRH3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBG2Q9NRH3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBG2Q9NRH3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBG2Q9NRH3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBG2Q9NRH3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBG2Q9NRH3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBG2Q9NRH3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBG2Q9NRH3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBG2Q9NRH3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBG2Q9NRH3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBG2Q9NRH3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBG2Q9NRH3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBG2Q9NRH3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBG2Q9NRH3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBG2Q9NRH3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBG2Q9NRH3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBG2Q9NRH3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBG2Q9NRH3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBG2Q9NRH3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBG2Q9NRH3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBG2Q9NRH3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBG2Q9NRH3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBG2Q9NRH3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBG2Q9NRH3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBG2Q9NRH3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBG2Q9NRH3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBG2Q9NRH3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBG2Q9NRH3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBG2Q9NRH3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBG2Q9NRH3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBG2Q9NRH3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBG2Q9NRH3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBG2Q9NRH3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBG2Q9NRH3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBG2Q9NRH3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBG2Q9NRH3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBG2Q9NRH3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBG2Q9NRH3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBG2Q9NRH3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBG2Q9NRH3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBG2Q9NRH3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBG2Q9NRH3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBG2Q9NRH3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBG2Q9NRH3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBG2Q9NRH3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG2Q9NRH3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms