Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GDF3Q9NR23 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GDF3Q9NR23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GDF3Q9NR23 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GDF3Q9NR23 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GDF3Q9NR23 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GDF3Q9NR23 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GDF3Q9NR23 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GDF3Q9NR23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GDF3Q9NR23 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GDF3Q9NR23 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GDF3Q9NR23 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GDF3Q9NR23 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GDF3Q9NR23 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GDF3Q9NR23 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GDF3Q9NR23 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GDF3Q9NR23 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GDF3Q9NR23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GDF3Q9NR23 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GDF3Q9NR23 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GDF3Q9NR23 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GDF3Q9NR23 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GDF3Q9NR23 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GDF3Q9NR23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GDF3Q9NR23 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GDF3Q9NR23 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GDF3Q9NR23 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GDF3Q9NR23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GDF3Q9NR23 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GDF3Q9NR23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GDF3Q9NR23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GDF3Q9NR23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GDF3Q9NR23 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GDF3Q9NR23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GDF3Q9NR23 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GDF3Q9NR23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GDF3Q9NR23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GDF3Q9NR23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GDF3Q9NR23 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GDF3Q9NR23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GDF3Q9NR23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GDF3Q9NR23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GDF3Q9NR23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GDF3Q9NR23 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GDF3Q9NR23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GDF3Q9NR23 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GDF3Q9NR23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GDF3Q9NR23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GDF3Q9NR23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GDF3Q9NR23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GDF3Q9NR23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GDF3Q9NR23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GDF3Q9NR23 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GDF3Q9NR23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GDF3Q9NR23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GDF3Q9NR23 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF3Q9NR23 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms