Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NECTIN3Q9NQS3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN3Q9NQS3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN3Q9NQS3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN3Q9NQS3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN3Q9NQS3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NECTIN3Q9NQS3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN3Q9NQS3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN3Q9NQS3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN3Q9NQS3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN3Q9NQS3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN3Q9NQS3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN3Q9NQS3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN3Q9NQS3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN3Q9NQS3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN3Q9NQS3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN3Q9NQS3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN3Q9NQS3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN3Q9NQS3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN3Q9NQS3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN3Q9NQS3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN3Q9NQS3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN3Q9NQS3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN3Q9NQS3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN3Q9NQS3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN3Q9NQS3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NECTIN3Q9NQS3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NECTIN3Q9NQS3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NECTIN3Q9NQS3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN3Q9NQS3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NECTIN3Q9NQS3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NECTIN3Q9NQS3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN3Q9NQS3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN3Q9NQS3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN3Q9NQS3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NECTIN3Q9NQS3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NECTIN3Q9NQS3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN3Q9NQS3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN3Q9NQS3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN3Q9NQS3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN3Q9NQS3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN3Q9NQS3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NECTIN3Q9NQS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NECTIN3Q9NQS3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN3Q9NQS3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECTIN3Q9NQS3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN3Q9NQS3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN3Q9NQS3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECTIN3Q9NQS3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECTIN3Q9NQS3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN3Q9NQS3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN3Q9NQS3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECTIN3Q9NQS3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN3Q9NQS3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN3Q9NQS3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms