Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCRT2Q9NQ03 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCRT2Q9NQ03 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCRT2Q9NQ03 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCRT2Q9NQ03 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCRT2Q9NQ03 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCRT2Q9NQ03 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCRT2Q9NQ03 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCRT2Q9NQ03 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCRT2Q9NQ03 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT2Q9NQ03 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCRT2Q9NQ03 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCRT2Q9NQ03 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCRT2Q9NQ03 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT2Q9NQ03 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT2Q9NQ03 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCRT2Q9NQ03 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCRT2Q9NQ03 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCRT2Q9NQ03 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCRT2Q9NQ03 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCRT2Q9NQ03 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCRT2Q9NQ03 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCRT2Q9NQ03 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCRT2Q9NQ03 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCRT2Q9NQ03 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCRT2Q9NQ03 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCRT2Q9NQ03 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCRT2Q9NQ03 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCRT2Q9NQ03 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCRT2Q9NQ03 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCRT2Q9NQ03 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCRT2Q9NQ03 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCRT2Q9NQ03 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCRT2Q9NQ03 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCRT2Q9NQ03 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCRT2Q9NQ03 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCRT2Q9NQ03 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCRT2Q9NQ03 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCRT2Q9NQ03 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCRT2Q9NQ03 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SCRT2Q9NQ03 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCRT2Q9NQ03 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCRT2Q9NQ03 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCRT2Q9NQ03 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms