Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNK9Q9NPC2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNK9Q9NPC2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNK9Q9NPC2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNK9Q9NPC2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNK9Q9NPC2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNK9Q9NPC2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNK9Q9NPC2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNK9Q9NPC2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNK9Q9NPC2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNK9Q9NPC2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNK9Q9NPC2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNK9Q9NPC2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNK9Q9NPC2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNK9Q9NPC2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNK9Q9NPC2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNK9Q9NPC2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNK9Q9NPC2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNK9Q9NPC2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNK9Q9NPC2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNK9Q9NPC2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNK9Q9NPC2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNK9Q9NPC2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNK9Q9NPC2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNK9Q9NPC2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNK9Q9NPC2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNK9Q9NPC2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNK9Q9NPC2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNK9Q9NPC2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNK9Q9NPC2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNK9Q9NPC2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNK9Q9NPC2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNK9Q9NPC2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNK9Q9NPC2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNK9Q9NPC2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNK9Q9NPC2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNK9Q9NPC2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNK9Q9NPC2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNK9Q9NPC2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNK9Q9NPC2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNK9Q9NPC2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNK9Q9NPC2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNK9Q9NPC2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNK9Q9NPC2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNK9Q9NPC2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNK9Q9NPC2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNK9Q9NPC2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNK9Q9NPC2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNK9Q9NPC2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNK9Q9NPC2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNK9Q9NPC2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNK9Q9NPC2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNK9Q9NPC2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNK9Q9NPC2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNK9Q9NPC2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNK9Q9NPC2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNK9Q9NPC2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNK9Q9NPC2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNK9Q9NPC2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNK9Q9NPC2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNK9Q9NPC2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNK9Q9NPC2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNK9Q9NPC2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms