Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PNPLA8Q9NP80 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PNPLA8Q9NP80 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PNPLA8Q9NP80 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PNPLA8Q9NP80 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNPLA8Q9NP80 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PNPLA8Q9NP80 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PNPLA8Q9NP80 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PNPLA8Q9NP80 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNPLA8Q9NP80 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNPLA8Q9NP80 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNPLA8Q9NP80 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNPLA8Q9NP80 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PNPLA8Q9NP80 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PNPLA8Q9NP80 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PNPLA8Q9NP80 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PNPLA8Q9NP80 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PNPLA8Q9NP80 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PNPLA8Q9NP80 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PNPLA8Q9NP80 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PNPLA8Q9NP80 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PNPLA8Q9NP80 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PNPLA8Q9NP80 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PNPLA8Q9NP80 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PNPLA8Q9NP80 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PNPLA8Q9NP80 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PNPLA8Q9NP80 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PNPLA8Q9NP80 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PNPLA8Q9NP80 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PNPLA8Q9NP80 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PNPLA8Q9NP80 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PNPLA8Q9NP80 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PNPLA8Q9NP80 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PNPLA8Q9NP80 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PNPLA8Q9NP80 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PNPLA8Q9NP80 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PNPLA8Q9NP80 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PNPLA8Q9NP80 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PNPLA8Q9NP80 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PNPLA8Q9NP80 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PNPLA8Q9NP80 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNPLA8Q9NP80 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNPLA8Q9NP80 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNPLA8Q9NP80 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PNPLA8Q9NP80 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PNPLA8Q9NP80 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PNPLA8Q9NP80 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PNPLA8Q9NP80 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PNPLA8Q9NP80 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PNPLA8Q9NP80 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PNPLA8Q9NP80 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PNPLA8Q9NP80 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PNPLA8Q9NP80 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PNPLA8Q9NP80 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PNPLA8Q9NP80 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNPLA8Q9NP80 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNPLA8Q9NP80 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNPLA8Q9NP80 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNPLA8Q9NP80 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PNPLA8Q9NP80 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNPLA8Q9NP80 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNPLA8Q9NP80 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNPLA8Q9NP80 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNPLA8Q9NP80 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNPLA8Q9NP80 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNPLA8Q9NP80 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PNPLA8Q9NP80 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNPLA8Q9NP80 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNPLA8Q9NP80 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PNPLA8Q9NP80 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PNPLA8Q9NP80 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms