Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB18Q9NP72 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB18Q9NP72 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB18Q9NP72 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB18Q9NP72 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB18Q9NP72 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB18Q9NP72 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB18Q9NP72 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB18Q9NP72 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB18Q9NP72 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB18Q9NP72 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB18Q9NP72 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB18Q9NP72 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB18Q9NP72 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB18Q9NP72 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB18Q9NP72 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB18Q9NP72 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB18Q9NP72 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB18Q9NP72 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB18Q9NP72 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB18Q9NP72 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB18Q9NP72 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB18Q9NP72 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB18Q9NP72 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB18Q9NP72 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB18Q9NP72 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB18Q9NP72 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB18Q9NP72 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB18Q9NP72 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB18Q9NP72 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB18Q9NP72 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB18Q9NP72 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB18Q9NP72 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB18Q9NP72 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB18Q9NP72 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB18Q9NP72 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB18Q9NP72 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB18Q9NP72 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB18Q9NP72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB18Q9NP72 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB18Q9NP72 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB18Q9NP72 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB18Q9NP72 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB18Q9NP72 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB18Q9NP72 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB18Q9NP72 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB18Q9NP72 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB18Q9NP72 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB18Q9NP72 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB18Q9NP72 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB18Q9NP72 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB18Q9NP72 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB18Q9NP72 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB18Q9NP72 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB18Q9NP72 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB18Q9NP72 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB18Q9NP72 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB18Q9NP72 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB18Q9NP72 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms