Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC4Q9NNZ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC4Q9NNZ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAJC4Q9NNZ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJC4Q9NNZ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC4Q9NNZ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC4Q9NNZ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC4Q9NNZ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC4Q9NNZ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC4Q9NNZ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC4Q9NNZ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC4Q9NNZ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC4Q9NNZ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC4Q9NNZ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC4Q9NNZ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC4Q9NNZ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC4Q9NNZ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC4Q9NNZ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC4Q9NNZ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC4Q9NNZ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC4Q9NNZ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms