Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCCC2Q9HCC0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCCC2Q9HCC0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCC2Q9HCC0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MCCC2Q9HCC0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCC2Q9HCC0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCCC2Q9HCC0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCCC2Q9HCC0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCCC2Q9HCC0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCCC2Q9HCC0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCCC2Q9HCC0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCCC2Q9HCC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCCC2Q9HCC0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCCC2Q9HCC0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCCC2Q9HCC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCC2Q9HCC0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCCC2Q9HCC0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCCC2Q9HCC0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCCC2Q9HCC0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCC2Q9HCC0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCCC2Q9HCC0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCCC2Q9HCC0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCCC2Q9HCC0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCCC2Q9HCC0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCCC2Q9HCC0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCC2Q9HCC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCC2Q9HCC0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCC2Q9HCC0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCCC2Q9HCC0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCC2Q9HCC0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCCC2Q9HCC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCC2Q9HCC0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCC2Q9HCC0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCC2Q9HCC0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCCC2Q9HCC0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCCC2Q9HCC0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCCC2Q9HCC0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCCC2Q9HCC0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCC2Q9HCC0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCC2Q9HCC0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCC2Q9HCC0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC2Q9HCC0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCC2Q9HCC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCCC2Q9HCC0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCC2Q9HCC0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCCC2Q9HCC0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCC2Q9HCC0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms