Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM165Q9HC07 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM165Q9HC07 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM165Q9HC07 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM165Q9HC07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM165Q9HC07 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM165Q9HC07 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM165Q9HC07 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM165Q9HC07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM165Q9HC07 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM165Q9HC07 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM165Q9HC07 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM165Q9HC07 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM165Q9HC07 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM165Q9HC07 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM165Q9HC07 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM165Q9HC07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM165Q9HC07 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM165Q9HC07 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM165Q9HC07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM165Q9HC07 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM165Q9HC07 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM165Q9HC07 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM165Q9HC07 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM165Q9HC07 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM165Q9HC07 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM165Q9HC07 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM165Q9HC07 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM165Q9HC07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM165Q9HC07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM165Q9HC07 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM165Q9HC07 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM165Q9HC07 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM165Q9HC07 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM165Q9HC07 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM165Q9HC07 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM165Q9HC07 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM165Q9HC07 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM165Q9HC07 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM165Q9HC07 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM165Q9HC07 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM165Q9HC07 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM165Q9HC07 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM165Q9HC07 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM165Q9HC07 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM165Q9HC07 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM165Q9HC07 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM165Q9HC07 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM165Q9HC07 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms