Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTN4Q9HB63 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTN4Q9HB63 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTN4Q9HB63 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTN4Q9HB63 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTN4Q9HB63 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTN4Q9HB63 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTN4Q9HB63 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NTN4Q9HB63 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NTN4Q9HB63 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NTN4Q9HB63 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTN4Q9HB63 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTN4Q9HB63 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NTN4Q9HB63 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTN4Q9HB63 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTN4Q9HB63 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTN4Q9HB63 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTN4Q9HB63 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTN4Q9HB63 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTN4Q9HB63 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTN4Q9HB63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTN4Q9HB63 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTN4Q9HB63 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTN4Q9HB63 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTN4Q9HB63 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NTN4Q9HB63 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTN4Q9HB63 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NTN4Q9HB63 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NTN4Q9HB63 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTN4Q9HB63 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTN4Q9HB63 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTN4Q9HB63 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NTN4Q9HB63 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTN4Q9HB63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTN4Q9HB63 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NTN4Q9HB63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NTN4Q9HB63 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NTN4Q9HB63 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NTN4Q9HB63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTN4Q9HB63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTN4Q9HB63 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTN4Q9HB63 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTN4Q9HB63 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTN4Q9HB63 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms