Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF556Q9HAH1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF556Q9HAH1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF556Q9HAH1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF556Q9HAH1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF556Q9HAH1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF556Q9HAH1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF556Q9HAH1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF556Q9HAH1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF556Q9HAH1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF556Q9HAH1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF556Q9HAH1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF556Q9HAH1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF556Q9HAH1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF556Q9HAH1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF556Q9HAH1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF556Q9HAH1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF556Q9HAH1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF556Q9HAH1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF556Q9HAH1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF556Q9HAH1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF556Q9HAH1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF556Q9HAH1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF556Q9HAH1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF556Q9HAH1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF556Q9HAH1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF556Q9HAH1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF556Q9HAH1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF556Q9HAH1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF556Q9HAH1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF556Q9HAH1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF556Q9HAH1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF556Q9HAH1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF556Q9HAH1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF556Q9HAH1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF556Q9HAH1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF556Q9HAH1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF556Q9HAH1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF556Q9HAH1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF556Q9HAH1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF556Q9HAH1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms