Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1BQ9H9Y6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1BQ9H9Y6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1BQ9H9Y6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1BQ9H9Y6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1BQ9H9Y6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1BQ9H9Y6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1BQ9H9Y6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1BQ9H9Y6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1BQ9H9Y6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1BQ9H9Y6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1BQ9H9Y6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1BQ9H9Y6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1BQ9H9Y6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1BQ9H9Y6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1BQ9H9Y6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR1BQ9H9Y6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1BQ9H9Y6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1BQ9H9Y6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1BQ9H9Y6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1BQ9H9Y6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1BQ9H9Y6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1BQ9H9Y6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1BQ9H9Y6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1BQ9H9Y6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1BQ9H9Y6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1BQ9H9Y6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1BQ9H9Y6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR1BQ9H9Y6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR1BQ9H9Y6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1BQ9H9Y6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1BQ9H9Y6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1BQ9H9Y6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1BQ9H9Y6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1BQ9H9Y6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1BQ9H9Y6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1BQ9H9Y6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1BQ9H9Y6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1BQ9H9Y6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1BQ9H9Y6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1BQ9H9Y6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1BQ9H9Y6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1BQ9H9Y6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1BQ9H9Y6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1BQ9H9Y6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1BQ9H9Y6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1BQ9H9Y6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1BQ9H9Y6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1BQ9H9Y6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1BQ9H9Y6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1BQ9H9Y6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1BQ9H9Y6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1BQ9H9Y6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1BQ9H9Y6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1BQ9H9Y6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1BQ9H9Y6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1BQ9H9Y6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1BQ9H9Y6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1BQ9H9Y6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1BQ9H9Y6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1BQ9H9Y6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1BQ9H9Y6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1BQ9H9Y6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms