Protein–RNA interactions for Protein: Q9H853

TUBA4B, Putative tubulin-like protein alpha-4B, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4BQ9H853 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA4BQ9H853 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA4BQ9H853 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA4BQ9H853 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA4BQ9H853 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA4BQ9H853 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4BQ9H853 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA4BQ9H853 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4BQ9H853 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4BQ9H853 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA4BQ9H853 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA4BQ9H853 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA4BQ9H853 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA4BQ9H853 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA4BQ9H853 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4BQ9H853 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4BQ9H853 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4BQ9H853 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4BQ9H853 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA4BQ9H853 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4BQ9H853 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4BQ9H853 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4BQ9H853 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4BQ9H853 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4BQ9H853 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4BQ9H853 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4BQ9H853 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4BQ9H853 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4BQ9H853 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA4BQ9H853 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA4BQ9H853 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4BQ9H853 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4BQ9H853 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA4BQ9H853 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA4BQ9H853 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA4BQ9H853 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA4BQ9H853 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA4BQ9H853 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4BQ9H853 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA4BQ9H853 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA4BQ9H853 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA4BQ9H853 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4BQ9H853 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4BQ9H853 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4BQ9H853 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4BQ9H853 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4BQ9H853 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4BQ9H853 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4BQ9H853 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4BQ9H853 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4BQ9H853 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms