Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXorf56Q9H5V9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXorf56Q9H5V9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXorf56Q9H5V9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXorf56Q9H5V9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXorf56Q9H5V9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXorf56Q9H5V9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXorf56Q9H5V9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXorf56Q9H5V9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXorf56Q9H5V9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXorf56Q9H5V9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXorf56Q9H5V9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXorf56Q9H5V9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CXorf56Q9H5V9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXorf56Q9H5V9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXorf56Q9H5V9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXorf56Q9H5V9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXorf56Q9H5V9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CXorf56Q9H5V9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXorf56Q9H5V9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXorf56Q9H5V9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXorf56Q9H5V9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXorf56Q9H5V9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CXorf56Q9H5V9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CXorf56Q9H5V9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXorf56Q9H5V9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXorf56Q9H5V9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXorf56Q9H5V9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXorf56Q9H5V9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXorf56Q9H5V9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXorf56Q9H5V9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXorf56Q9H5V9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXorf56Q9H5V9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXorf56Q9H5V9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXorf56Q9H5V9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXorf56Q9H5V9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXorf56Q9H5V9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXorf56Q9H5V9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXorf56Q9H5V9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXorf56Q9H5V9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXorf56Q9H5V9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXorf56Q9H5V9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXorf56Q9H5V9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CXorf56Q9H5V9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXorf56Q9H5V9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXorf56Q9H5V9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXorf56Q9H5V9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXorf56Q9H5V9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXorf56Q9H5V9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms