Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCXQ9H320 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCXQ9H320 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCXQ9H320 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCXQ9H320 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCXQ9H320 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCXQ9H320 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCXQ9H320 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VCXQ9H320 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VCXQ9H320 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCXQ9H320 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCXQ9H320 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCXQ9H320 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCXQ9H320 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCXQ9H320 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCXQ9H320 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCXQ9H320 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCXQ9H320 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCXQ9H320 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCXQ9H320 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCXQ9H320 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCXQ9H320 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCXQ9H320 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCXQ9H320 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCXQ9H320 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCXQ9H320 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCXQ9H320 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCXQ9H320 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCXQ9H320 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCXQ9H320 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCXQ9H320 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCXQ9H320 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCXQ9H320 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCXQ9H320 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCXQ9H320 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCXQ9H320 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCXQ9H320 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCXQ9H320 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCXQ9H320 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCXQ9H320 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCXQ9H320 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VCXQ9H320 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCXQ9H320 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCXQ9H320 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCXQ9H320 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCXQ9H320 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCXQ9H320 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCXQ9H320 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCXQ9H320 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VCXQ9H320 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCXQ9H320 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCXQ9H320 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCXQ9H320 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCXQ9H320 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCXQ9H320 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCXQ9H320 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCXQ9H320 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCXQ9H320 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCXQ9H320 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCXQ9H320 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCXQ9H320 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCXQ9H320 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms