Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
YIPF3Q9GZM5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YIPF3Q9GZM5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YIPF3Q9GZM5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
YIPF3Q9GZM5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
YIPF3Q9GZM5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
YIPF3Q9GZM5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YIPF3Q9GZM5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YIPF3Q9GZM5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF3Q9GZM5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YIPF3Q9GZM5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YIPF3Q9GZM5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
YIPF3Q9GZM5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF3Q9GZM5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YIPF3Q9GZM5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YIPF3Q9GZM5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YIPF3Q9GZM5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YIPF3Q9GZM5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YIPF3Q9GZM5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YIPF3Q9GZM5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YIPF3Q9GZM5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YIPF3Q9GZM5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YIPF3Q9GZM5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YIPF3Q9GZM5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
YIPF3Q9GZM5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
YIPF3Q9GZM5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
YIPF3Q9GZM5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YIPF3Q9GZM5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YIPF3Q9GZM5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YIPF3Q9GZM5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YIPF3Q9GZM5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YIPF3Q9GZM5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YIPF3Q9GZM5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YIPF3Q9GZM5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YIPF3Q9GZM5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YIPF3Q9GZM5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YIPF3Q9GZM5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YIPF3Q9GZM5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YIPF3Q9GZM5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YIPF3Q9GZM5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YIPF3Q9GZM5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YIPF3Q9GZM5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF3Q9GZM5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YIPF3Q9GZM5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YIPF3Q9GZM5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF3Q9GZM5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF3Q9GZM5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF3Q9GZM5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YIPF3Q9GZM5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF3Q9GZM5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YIPF3Q9GZM5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YIPF3Q9GZM5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms