Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUSAP1Q9BXS6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUSAP1Q9BXS6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUSAP1Q9BXS6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUSAP1Q9BXS6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUSAP1Q9BXS6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUSAP1Q9BXS6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUSAP1Q9BXS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUSAP1Q9BXS6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUSAP1Q9BXS6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUSAP1Q9BXS6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUSAP1Q9BXS6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUSAP1Q9BXS6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUSAP1Q9BXS6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUSAP1Q9BXS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUSAP1Q9BXS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUSAP1Q9BXS6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUSAP1Q9BXS6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUSAP1Q9BXS6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUSAP1Q9BXS6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUSAP1Q9BXS6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUSAP1Q9BXS6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUSAP1Q9BXS6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUSAP1Q9BXS6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUSAP1Q9BXS6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUSAP1Q9BXS6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUSAP1Q9BXS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUSAP1Q9BXS6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUSAP1Q9BXS6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUSAP1Q9BXS6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUSAP1Q9BXS6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUSAP1Q9BXS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUSAP1Q9BXS6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUSAP1Q9BXS6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUSAP1Q9BXS6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUSAP1Q9BXS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUSAP1Q9BXS6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUSAP1Q9BXS6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUSAP1Q9BXS6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUSAP1Q9BXS6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUSAP1Q9BXS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUSAP1Q9BXS6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUSAP1Q9BXS6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUSAP1Q9BXS6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUSAP1Q9BXS6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUSAP1Q9BXS6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUSAP1Q9BXS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUSAP1Q9BXS6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUSAP1Q9BXS6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUSAP1Q9BXS6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUSAP1Q9BXS6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUSAP1Q9BXS6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUSAP1Q9BXS6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUSAP1Q9BXS6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUSAP1Q9BXS6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUSAP1Q9BXS6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUSAP1Q9BXS6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUSAP1Q9BXS6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUSAP1Q9BXS6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUSAP1Q9BXS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUSAP1Q9BXS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUSAP1Q9BXS6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUSAP1Q9BXS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUSAP1Q9BXS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUSAP1Q9BXS6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUSAP1Q9BXS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUSAP1Q9BXS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUSAP1Q9BXS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUSAP1Q9BXS6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUSAP1Q9BXS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUSAP1Q9BXS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUSAP1Q9BXS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUSAP1Q9BXS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUSAP1Q9BXS6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUSAP1Q9BXS6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUSAP1Q9BXS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUSAP1Q9BXS6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUSAP1Q9BXS6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUSAP1Q9BXS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUSAP1Q9BXS6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUSAP1Q9BXS6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUSAP1Q9BXS6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NUSAP1Q9BXS6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms