Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC12A9Q9BXP2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC12A9Q9BXP2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC12A9Q9BXP2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC12A9Q9BXP2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC12A9Q9BXP2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC12A9Q9BXP2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC12A9Q9BXP2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC12A9Q9BXP2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC12A9Q9BXP2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC12A9Q9BXP2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC12A9Q9BXP2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC12A9Q9BXP2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC12A9Q9BXP2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC12A9Q9BXP2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC12A9Q9BXP2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC12A9Q9BXP2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC12A9Q9BXP2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC12A9Q9BXP2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC12A9Q9BXP2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC12A9Q9BXP2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC12A9Q9BXP2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC12A9Q9BXP2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC12A9Q9BXP2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC12A9Q9BXP2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A9Q9BXP2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC12A9Q9BXP2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC12A9Q9BXP2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC12A9Q9BXP2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC12A9Q9BXP2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A9Q9BXP2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A9Q9BXP2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC12A9Q9BXP2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A9Q9BXP2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC12A9Q9BXP2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A9Q9BXP2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A9Q9BXP2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC12A9Q9BXP2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC12A9Q9BXP2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A9Q9BXP2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms