Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI9

C1QTNF6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF6Q9BXI9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms