Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP58Q9BVL2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP58Q9BVL2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NUP58Q9BVL2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NUP58Q9BVL2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUP58Q9BVL2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUP58Q9BVL2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUP58Q9BVL2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUP58Q9BVL2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NUP58Q9BVL2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUP58Q9BVL2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUP58Q9BVL2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUP58Q9BVL2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP58Q9BVL2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP58Q9BVL2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP58Q9BVL2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP58Q9BVL2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP58Q9BVL2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP58Q9BVL2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP58Q9BVL2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP58Q9BVL2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP58Q9BVL2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP58Q9BVL2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUP58Q9BVL2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP58Q9BVL2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP58Q9BVL2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP58Q9BVL2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP58Q9BVL2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP58Q9BVL2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP58Q9BVL2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP58Q9BVL2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP58Q9BVL2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP58Q9BVL2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP58Q9BVL2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP58Q9BVL2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP58Q9BVL2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP58Q9BVL2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP58Q9BVL2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP58Q9BVL2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP58Q9BVL2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP58Q9BVL2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP58Q9BVL2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP58Q9BVL2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP58Q9BVL2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP58Q9BVL2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP58Q9BVL2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP58Q9BVL2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP58Q9BVL2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP58Q9BVL2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP58Q9BVL2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NUP58Q9BVL2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP58Q9BVL2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP58Q9BVL2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP58Q9BVL2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP58Q9BVL2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUP58Q9BVL2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP58Q9BVL2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP58Q9BVL2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP58Q9BVL2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP58Q9BVL2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP58Q9BVL2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP58Q9BVL2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP58Q9BVL2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP58Q9BVL2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP58Q9BVL2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP58Q9BVL2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP58Q9BVL2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP58Q9BVL2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms