Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF3Q9BU61 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF3Q9BU61 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDUFAF3Q9BU61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF3Q9BU61 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF3Q9BU61 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF3Q9BU61 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFAF3Q9BU61 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF3Q9BU61 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF3Q9BU61 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF3Q9BU61 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFAF3Q9BU61 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFAF3Q9BU61 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFAF3Q9BU61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFAF3Q9BU61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFAF3Q9BU61 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFAF3Q9BU61 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFAF3Q9BU61 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFAF3Q9BU61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFAF3Q9BU61 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF3Q9BU61 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFAF3Q9BU61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFAF3Q9BU61 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF3Q9BU61 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF3Q9BU61 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF3Q9BU61 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF3Q9BU61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF3Q9BU61 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF3Q9BU61 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFAF3Q9BU61 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms