Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS4Q9BRT9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS4Q9BRT9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINS4Q9BRT9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINS4Q9BRT9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS4Q9BRT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS4Q9BRT9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS4Q9BRT9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS4Q9BRT9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS4Q9BRT9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS4Q9BRT9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS4Q9BRT9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS4Q9BRT9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS4Q9BRT9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS4Q9BRT9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS4Q9BRT9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS4Q9BRT9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS4Q9BRT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS4Q9BRT9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS4Q9BRT9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS4Q9BRT9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS4Q9BRT9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS4Q9BRT9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS4Q9BRT9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GINS4Q9BRT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS4Q9BRT9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS4Q9BRT9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS4Q9BRT9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS4Q9BRT9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS4Q9BRT9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS4Q9BRT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS4Q9BRT9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS4Q9BRT9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS4Q9BRT9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS4Q9BRT9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS4Q9BRT9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS4Q9BRT9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS4Q9BRT9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS4Q9BRT9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS4Q9BRT9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS4Q9BRT9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS4Q9BRT9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS4Q9BRT9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINS4Q9BRT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS4Q9BRT9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS4Q9BRT9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS4Q9BRT9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS4Q9BRT9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS4Q9BRT9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINS4Q9BRT9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS4Q9BRT9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINS4Q9BRT9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS4Q9BRT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS4Q9BRT9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS4Q9BRT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS4Q9BRT9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS4Q9BRT9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS4Q9BRT9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS4Q9BRT9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS4Q9BRT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms