Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF8Q9BRL6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF8Q9BRL6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF8Q9BRL6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF8Q9BRL6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF8Q9BRL6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF8Q9BRL6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF8Q9BRL6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF8Q9BRL6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF8Q9BRL6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF8Q9BRL6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF8Q9BRL6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF8Q9BRL6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF8Q9BRL6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF8Q9BRL6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRSF8Q9BRL6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF8Q9BRL6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF8Q9BRL6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF8Q9BRL6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF8Q9BRL6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF8Q9BRL6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF8Q9BRL6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF8Q9BRL6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF8Q9BRL6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF8Q9BRL6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF8Q9BRL6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF8Q9BRL6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF8Q9BRL6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF8Q9BRL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF8Q9BRL6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF8Q9BRL6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF8Q9BRL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF8Q9BRL6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF8Q9BRL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF8Q9BRL6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF8Q9BRL6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF8Q9BRL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF8Q9BRL6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF8Q9BRL6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms