Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZSWIM1Q9BR11 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZSWIM1Q9BR11 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZSWIM1Q9BR11 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZSWIM1Q9BR11 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZSWIM1Q9BR11 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZSWIM1Q9BR11 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZSWIM1Q9BR11 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZSWIM1Q9BR11 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZSWIM1Q9BR11 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZSWIM1Q9BR11 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZSWIM1Q9BR11 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZSWIM1Q9BR11 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZSWIM1Q9BR11 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZSWIM1Q9BR11 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZSWIM1Q9BR11 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZSWIM1Q9BR11 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZSWIM1Q9BR11 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZSWIM1Q9BR11 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZSWIM1Q9BR11 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZSWIM1Q9BR11 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZSWIM1Q9BR11 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZSWIM1Q9BR11 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZSWIM1Q9BR11 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZSWIM1Q9BR11 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZSWIM1Q9BR11 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZSWIM1Q9BR11 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZSWIM1Q9BR11 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZSWIM1Q9BR11 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZSWIM1Q9BR11 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZSWIM1Q9BR11 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZSWIM1Q9BR11 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZSWIM1Q9BR11 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZSWIM1Q9BR11 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZSWIM1Q9BR11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZSWIM1Q9BR11 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZSWIM1Q9BR11 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZSWIM1Q9BR11 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZSWIM1Q9BR11 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZSWIM1Q9BR11 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZSWIM1Q9BR11 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZSWIM1Q9BR11 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZSWIM1Q9BR11 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZSWIM1Q9BR11 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZSWIM1Q9BR11 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZSWIM1Q9BR11 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZSWIM1Q9BR11 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZSWIM1Q9BR11 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZSWIM1Q9BR11 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZSWIM1Q9BR11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZSWIM1Q9BR11 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZSWIM1Q9BR11 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms