Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMCHL2Q9BQD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHL2Q9BQD1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHL2Q9BQD1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHL2Q9BQD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMCHL2Q9BQD1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMCHL2Q9BQD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMCHL2Q9BQD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMCHL2Q9BQD1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMCHL2Q9BQD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMCHL2Q9BQD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMCHL2Q9BQD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMCHL2Q9BQD1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMCHL2Q9BQD1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMCHL2Q9BQD1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMCHL2Q9BQD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMCHL2Q9BQD1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMCHL2Q9BQD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMCHL2Q9BQD1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMCHL2Q9BQD1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMCHL2Q9BQD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMCHL2Q9BQD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMCHL2Q9BQD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMCHL2Q9BQD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMCHL2Q9BQD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMCHL2Q9BQD1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMCHL2Q9BQD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMCHL2Q9BQD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMCHL2Q9BQD1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMCHL2Q9BQD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMCHL2Q9BQD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PMCHL2Q9BQD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMCHL2Q9BQD1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMCHL2Q9BQD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHL2Q9BQD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMCHL2Q9BQD1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMCHL2Q9BQD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHL2Q9BQD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL2Q9BQD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHL2Q9BQD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHL2Q9BQD1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHL2Q9BQD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMCHL2Q9BQD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PMCHL2Q9BQD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMCHL2Q9BQD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHL2Q9BQD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms