Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL3Q99963 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL3Q99963 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3GL3Q99963 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3GL3Q99963 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3GL3Q99963 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3GL3Q99963 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3GL3Q99963 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH3GL3Q99963 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3GL3Q99963 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3GL3Q99963 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3GL3Q99963 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3GL3Q99963 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3GL3Q99963 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3GL3Q99963 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3GL3Q99963 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH3GL3Q99963 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3GL3Q99963 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL3Q99963 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3GL3Q99963 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SH3GL3Q99963 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3GL3Q99963 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3GL3Q99963 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3GL3Q99963 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3GL3Q99963 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3GL3Q99963 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3GL3Q99963 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3GL3Q99963 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3GL3Q99963 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3GL3Q99963 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL3Q99963 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3GL3Q99963 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3GL3Q99963 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3GL3Q99963 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL3Q99963 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3GL3Q99963 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3GL3Q99963 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SH3GL3Q99963 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3GL3Q99963 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3GL3Q99963 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3GL3Q99963 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3GL3Q99963 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3GL3Q99963 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3GL3Q99963 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3GL3Q99963 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3GL3Q99963 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3GL3Q99963 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3GL3Q99963 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms