Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SCAF11Q99590 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
SCAF11Q99590 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SCAF11Q99590 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SCAF11Q99590 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SCAF11Q99590 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
SCAF11Q99590 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SCAF11Q99590 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SCAF11Q99590 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SCAF11Q99590 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SCAF11Q99590 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SCAF11Q99590 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SCAF11Q99590 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.43
SCAF11Q99590 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
SCAF11Q99590 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SCAF11Q99590 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SCAF11Q99590 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SCAF11Q99590 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SCAF11Q99590 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SCAF11Q99590 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SCAF11Q99590 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SCAF11Q99590 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SCAF11Q99590 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SCAF11Q99590 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SCAF11Q99590 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
SCAF11Q99590 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SCAF11Q99590 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SCAF11Q99590 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
SCAF11Q99590 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SCAF11Q99590 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
SCAF11Q99590 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SCAF11Q99590 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SCAF11Q99590 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
SCAF11Q99590 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SCAF11Q99590 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SCAF11Q99590 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SCAF11Q99590 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
SCAF11Q99590 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SCAF11Q99590 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
SCAF11Q99590 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SCAF11Q99590 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SCAF11Q99590 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SCAF11Q99590 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SCAF11Q99590 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SCAF11Q99590 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SCAF11Q99590 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SCAF11Q99590 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SCAF11Q99590 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SCAF11Q99590 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SCAF11Q99590 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
SCAF11Q99590 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SCAF11Q99590 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
SCAF11Q99590 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SCAF11Q99590 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SCAF11Q99590 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SCAF11Q99590 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SCAF11Q99590 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SCAF11Q99590 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SCAF11Q99590 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SCAF11Q99590 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SCAF11Q99590 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SCAF11Q99590 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SCAF11Q99590 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SCAF11Q99590 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SCAF11Q99590 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SCAF11Q99590 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SCAF11Q99590 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SCAF11Q99590 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SCAF11Q99590 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SCAF11Q99590 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SCAF11Q99590 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SCAF11Q99590 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SCAF11Q99590 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
SCAF11Q99590 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SCAF11Q99590 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SCAF11Q99590 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
SCAF11Q99590 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SCAF11Q99590 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SCAF11Q99590 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SCAF11Q99590 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SCAF11Q99590 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SCAF11Q99590 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SCAF11Q99590 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SCAF11Q99590 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SCAF11Q99590 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SCAF11Q99590 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
SCAF11Q99590 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SCAF11Q99590 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SCAF11Q99590 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SCAF11Q99590 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SCAF11Q99590 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SCAF11Q99590 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SCAF11Q99590 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SCAF11Q99590 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
SCAF11Q99590 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SCAF11Q99590 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SCAF11Q99590 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SCAF11Q99590 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SCAF11Q99590 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SCAF11Q99590 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms