Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PNKPQ96T60 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PNKPQ96T60 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PNKPQ96T60 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PNKPQ96T60 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PNKPQ96T60 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PNKPQ96T60 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNKPQ96T60 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PNKPQ96T60 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PNKPQ96T60 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PNKPQ96T60 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PNKPQ96T60 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PNKPQ96T60 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNKPQ96T60 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNKPQ96T60 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNKPQ96T60 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PNKPQ96T60 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PNKPQ96T60 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PNKPQ96T60 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNKPQ96T60 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNKPQ96T60 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNKPQ96T60 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PNKPQ96T60 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PNKPQ96T60 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNKPQ96T60 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNKPQ96T60 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PNKPQ96T60 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PNKPQ96T60 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNKPQ96T60 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNKPQ96T60 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PNKPQ96T60 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PNKPQ96T60 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PNKPQ96T60 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNKPQ96T60 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNKPQ96T60 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNKPQ96T60 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PNKPQ96T60 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PNKPQ96T60 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PNKPQ96T60 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PNKPQ96T60 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PNKPQ96T60 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PNKPQ96T60 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PNKPQ96T60 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PNKPQ96T60 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PNKPQ96T60 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PNKPQ96T60 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PNKPQ96T60 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PNKPQ96T60 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PNKPQ96T60 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PNKPQ96T60 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PNKPQ96T60 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PNKPQ96T60 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PNKPQ96T60 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PNKPQ96T60 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PNKPQ96T60 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PNKPQ96T60 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNKPQ96T60 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNKPQ96T60 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNKPQ96T60 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PNKPQ96T60 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms