Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSPAN18Q96SJ8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSPAN18Q96SJ8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TSPAN18Q96SJ8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TSPAN18Q96SJ8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TSPAN18Q96SJ8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TSPAN18Q96SJ8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TSPAN18Q96SJ8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TSPAN18Q96SJ8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TSPAN18Q96SJ8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TSPAN18Q96SJ8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TSPAN18Q96SJ8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TSPAN18Q96SJ8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TSPAN18Q96SJ8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TSPAN18Q96SJ8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSPAN18Q96SJ8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TSPAN18Q96SJ8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TSPAN18Q96SJ8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TSPAN18Q96SJ8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TSPAN18Q96SJ8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TSPAN18Q96SJ8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TSPAN18Q96SJ8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TSPAN18Q96SJ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TSPAN18Q96SJ8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TSPAN18Q96SJ8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TSPAN18Q96SJ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TSPAN18Q96SJ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TSPAN18Q96SJ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TSPAN18Q96SJ8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TSPAN18Q96SJ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TSPAN18Q96SJ8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TSPAN18Q96SJ8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TSPAN18Q96SJ8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TSPAN18Q96SJ8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TSPAN18Q96SJ8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TSPAN18Q96SJ8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TSPAN18Q96SJ8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TSPAN18Q96SJ8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TSPAN18Q96SJ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TSPAN18Q96SJ8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TSPAN18Q96SJ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TSPAN18Q96SJ8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TSPAN18Q96SJ8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TSPAN18Q96SJ8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TSPAN18Q96SJ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TSPAN18Q96SJ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TSPAN18Q96SJ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TSPAN18Q96SJ8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TSPAN18Q96SJ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSPAN18Q96SJ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSPAN18Q96SJ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSPAN18Q96SJ8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSPAN18Q96SJ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TSPAN18Q96SJ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSPAN18Q96SJ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSPAN18Q96SJ8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSPAN18Q96SJ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSPAN18Q96SJ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSPAN18Q96SJ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSPAN18Q96SJ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSPAN18Q96SJ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSPAN18Q96SJ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSPAN18Q96SJ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSPAN18Q96SJ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSPAN18Q96SJ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSPAN18Q96SJ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSPAN18Q96SJ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSPAN18Q96SJ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TSPAN18Q96SJ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSPAN18Q96SJ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSPAN18Q96SJ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSPAN18Q96SJ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSPAN18Q96SJ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSPAN18Q96SJ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms