Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXN4Q96NZ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXN4Q96NZ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN4Q96NZ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN4Q96NZ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXN4Q96NZ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN4Q96NZ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN4Q96NZ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXN4Q96NZ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXN4Q96NZ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXN4Q96NZ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN4Q96NZ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN4Q96NZ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN4Q96NZ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN4Q96NZ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN4Q96NZ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXN4Q96NZ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN4Q96NZ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN4Q96NZ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXN4Q96NZ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXN4Q96NZ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXN4Q96NZ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXN4Q96NZ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXN4Q96NZ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN4Q96NZ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN4Q96NZ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXN4Q96NZ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN4Q96NZ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN4Q96NZ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXN4Q96NZ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXN4Q96NZ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXN4Q96NZ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXN4Q96NZ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXN4Q96NZ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXN4Q96NZ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXN4Q96NZ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN4Q96NZ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN4Q96NZ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN4Q96NZ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN4Q96NZ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXN4Q96NZ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN4Q96NZ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN4Q96NZ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN4Q96NZ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN4Q96NZ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN4Q96NZ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN4Q96NZ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN4Q96NZ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN4Q96NZ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN4Q96NZ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN4Q96NZ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms