Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00052Q96N35 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00052Q96N35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00052Q96N35 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00052Q96N35 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00052Q96N35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00052Q96N35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00052Q96N35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00052Q96N35 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00052Q96N35 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00052Q96N35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00052Q96N35 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00052Q96N35 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00052Q96N35 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00052Q96N35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00052Q96N35 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00052Q96N35 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00052Q96N35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00052Q96N35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00052Q96N35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00052Q96N35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00052Q96N35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00052Q96N35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00052Q96N35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00052Q96N35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00052Q96N35 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00052Q96N35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00052Q96N35 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00052Q96N35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00052Q96N35 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00052Q96N35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00052Q96N35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00052Q96N35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00052Q96N35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00052Q96N35 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00052Q96N35 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00052Q96N35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00052Q96N35 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00052Q96N35 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00052Q96N35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00052Q96N35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00052Q96N35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00052Q96N35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00052Q96N35 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00052Q96N35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00052Q96N35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00052Q96N35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00052Q96N35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00052Q96N35 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00052Q96N35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00052Q96N35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00052Q96N35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms