Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFAP44Q96MT7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFAP44Q96MT7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFAP44Q96MT7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFAP44Q96MT7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFAP44Q96MT7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CFAP44Q96MT7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFAP44Q96MT7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFAP44Q96MT7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFAP44Q96MT7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFAP44Q96MT7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP44Q96MT7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP44Q96MT7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFAP44Q96MT7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFAP44Q96MT7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFAP44Q96MT7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFAP44Q96MT7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP44Q96MT7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFAP44Q96MT7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFAP44Q96MT7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFAP44Q96MT7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFAP44Q96MT7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFAP44Q96MT7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CFAP44Q96MT7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFAP44Q96MT7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFAP44Q96MT7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFAP44Q96MT7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CFAP44Q96MT7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFAP44Q96MT7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFAP44Q96MT7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFAP44Q96MT7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFAP44Q96MT7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFAP44Q96MT7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CFAP44Q96MT7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CFAP44Q96MT7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFAP44Q96MT7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFAP44Q96MT7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFAP44Q96MT7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFAP44Q96MT7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFAP44Q96MT7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFAP44Q96MT7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFAP44Q96MT7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFAP44Q96MT7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFAP44Q96MT7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFAP44Q96MT7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFAP44Q96MT7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFAP44Q96MT7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFAP44Q96MT7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFAP44Q96MT7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFAP44Q96MT7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CFAP44Q96MT7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFAP44Q96MT7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFAP44Q96MT7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFAP44Q96MT7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFAP44Q96MT7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFAP44Q96MT7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFAP44Q96MT7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFAP44Q96MT7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CFAP44Q96MT7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFAP44Q96MT7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFAP44Q96MT7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFAP44Q96MT7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFAP44Q96MT7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFAP44Q96MT7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFAP44Q96MT7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFAP44Q96MT7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFAP44Q96MT7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFAP44Q96MT7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFAP44Q96MT7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFAP44Q96MT7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFAP44Q96MT7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFAP44Q96MT7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFAP44Q96MT7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFAP44Q96MT7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFAP44Q96MT7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP44Q96MT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP44Q96MT7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP44Q96MT7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFAP44Q96MT7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP44Q96MT7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP44Q96MT7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP44Q96MT7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFAP44Q96MT7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP44Q96MT7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP44Q96MT7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms