Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
STAC3Q96MF2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
STAC3Q96MF2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
STAC3Q96MF2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
STAC3Q96MF2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
STAC3Q96MF2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
STAC3Q96MF2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
STAC3Q96MF2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
STAC3Q96MF2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
STAC3Q96MF2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
STAC3Q96MF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
STAC3Q96MF2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
STAC3Q96MF2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
STAC3Q96MF2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
STAC3Q96MF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
STAC3Q96MF2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
STAC3Q96MF2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
STAC3Q96MF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
STAC3Q96MF2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
STAC3Q96MF2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
STAC3Q96MF2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
STAC3Q96MF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
STAC3Q96MF2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
STAC3Q96MF2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
STAC3Q96MF2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
STAC3Q96MF2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
STAC3Q96MF2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
STAC3Q96MF2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
STAC3Q96MF2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
STAC3Q96MF2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
STAC3Q96MF2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
STAC3Q96MF2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
STAC3Q96MF2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
STAC3Q96MF2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
STAC3Q96MF2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
STAC3Q96MF2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
STAC3Q96MF2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
STAC3Q96MF2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
STAC3Q96MF2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
STAC3Q96MF2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
STAC3Q96MF2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
STAC3Q96MF2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
STAC3Q96MF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
STAC3Q96MF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
STAC3Q96MF2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
STAC3Q96MF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
STAC3Q96MF2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
STAC3Q96MF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
STAC3Q96MF2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
STAC3Q96MF2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
STAC3Q96MF2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
STAC3Q96MF2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
STAC3Q96MF2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
STAC3Q96MF2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
STAC3Q96MF2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
STAC3Q96MF2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
STAC3Q96MF2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
STAC3Q96MF2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
STAC3Q96MF2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
STAC3Q96MF2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
STAC3Q96MF2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.61■■■■■ 4.09
STAC3Q96MF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
STAC3Q96MF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
STAC3Q96MF2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
STAC3Q96MF2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
STAC3Q96MF2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
STAC3Q96MF2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
STAC3Q96MF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
STAC3Q96MF2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
STAC3Q96MF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
STAC3Q96MF2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
STAC3Q96MF2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
STAC3Q96MF2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
STAC3Q96MF2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
STAC3Q96MF2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
STAC3Q96MF2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
STAC3Q96MF2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
STAC3Q96MF2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
STAC3Q96MF2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
STAC3Q96MF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
STAC3Q96MF2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
STAC3Q96MF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
STAC3Q96MF2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
STAC3Q96MF2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
STAC3Q96MF2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
STAC3Q96MF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
STAC3Q96MF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
STAC3Q96MF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
STAC3Q96MF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
STAC3Q96MF2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms