Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00479Q96M42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00479Q96M42 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00479Q96M42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00479Q96M42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00479Q96M42 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00479Q96M42 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00479Q96M42 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00479Q96M42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00479Q96M42 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00479Q96M42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00479Q96M42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00479Q96M42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00479Q96M42 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00479Q96M42 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00479Q96M42 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00479Q96M42 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00479Q96M42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00479Q96M42 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00479Q96M42 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00479Q96M42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00479Q96M42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00479Q96M42 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00479Q96M42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00479Q96M42 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00479Q96M42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00479Q96M42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00479Q96M42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00479Q96M42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00479Q96M42 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00479Q96M42 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00479Q96M42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00479Q96M42 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC00479Q96M42 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00479Q96M42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00479Q96M42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00479Q96M42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00479Q96M42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00479Q96M42 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00479Q96M42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00479Q96M42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00479Q96M42 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00479Q96M42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00479Q96M42 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00479Q96M42 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00479Q96M42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00479Q96M42 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00479Q96M42 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00479Q96M42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00479Q96M42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00479Q96M42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00479Q96M42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00479Q96M42 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00479Q96M42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00479Q96M42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00479Q96M42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00479Q96M42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00479Q96M42 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00479Q96M42 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00479Q96M42 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00479Q96M42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00479Q96M42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms