Protein–RNA interactions for Protein: Q96L33

RHOV, Rho-related GTP-binding protein RhoV, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOVQ96L33 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOVQ96L33 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOVQ96L33 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOVQ96L33 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOVQ96L33 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOVQ96L33 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOVQ96L33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOVQ96L33 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOVQ96L33 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOVQ96L33 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOVQ96L33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOVQ96L33 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOVQ96L33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOVQ96L33 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOVQ96L33 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOVQ96L33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOVQ96L33 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOVQ96L33 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOVQ96L33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOVQ96L33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOVQ96L33 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOVQ96L33 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOVQ96L33 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOVQ96L33 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOVQ96L33 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOVQ96L33 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOVQ96L33 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOVQ96L33 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOVQ96L33 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOVQ96L33 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOVQ96L33 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOVQ96L33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOVQ96L33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOVQ96L33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOVQ96L33 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOVQ96L33 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOVQ96L33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOVQ96L33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOVQ96L33 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOVQ96L33 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOVQ96L33 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOVQ96L33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOVQ96L33 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOVQ96L33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOVQ96L33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms