Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COX4I2Q96KJ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COX4I2Q96KJ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COX4I2Q96KJ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COX4I2Q96KJ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COX4I2Q96KJ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COX4I2Q96KJ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COX4I2Q96KJ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COX4I2Q96KJ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COX4I2Q96KJ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COX4I2Q96KJ9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COX4I2Q96KJ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COX4I2Q96KJ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX4I2Q96KJ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COX4I2Q96KJ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COX4I2Q96KJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COX4I2Q96KJ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COX4I2Q96KJ9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX4I2Q96KJ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX4I2Q96KJ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COX4I2Q96KJ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COX4I2Q96KJ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COX4I2Q96KJ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COX4I2Q96KJ9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COX4I2Q96KJ9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COX4I2Q96KJ9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX4I2Q96KJ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX4I2Q96KJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COX4I2Q96KJ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COX4I2Q96KJ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COX4I2Q96KJ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COX4I2Q96KJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COX4I2Q96KJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COX4I2Q96KJ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COX4I2Q96KJ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COX4I2Q96KJ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COX4I2Q96KJ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COX4I2Q96KJ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COX4I2Q96KJ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COX4I2Q96KJ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COX4I2Q96KJ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COX4I2Q96KJ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COX4I2Q96KJ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COX4I2Q96KJ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COX4I2Q96KJ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COX4I2Q96KJ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COX4I2Q96KJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COX4I2Q96KJ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COX4I2Q96KJ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COX4I2Q96KJ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COX4I2Q96KJ9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COX4I2Q96KJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COX4I2Q96KJ9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COX4I2Q96KJ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COX4I2Q96KJ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COX4I2Q96KJ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COX4I2Q96KJ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms