Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI2Q96DH6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI2Q96DH6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSI2Q96DH6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI2Q96DH6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSI2Q96DH6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSI2Q96DH6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI2Q96DH6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSI2Q96DH6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI2Q96DH6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI2Q96DH6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI2Q96DH6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI2Q96DH6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI2Q96DH6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI2Q96DH6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI2Q96DH6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI2Q96DH6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSI2Q96DH6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI2Q96DH6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI2Q96DH6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI2Q96DH6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI2Q96DH6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI2Q96DH6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI2Q96DH6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSI2Q96DH6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI2Q96DH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSI2Q96DH6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI2Q96DH6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI2Q96DH6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI2Q96DH6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI2Q96DH6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI2Q96DH6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI2Q96DH6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI2Q96DH6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI2Q96DH6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSI2Q96DH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSI2Q96DH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSI2Q96DH6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI2Q96DH6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI2Q96DH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI2Q96DH6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI2Q96DH6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI2Q96DH6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI2Q96DH6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI2Q96DH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSI2Q96DH6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSI2Q96DH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI2Q96DH6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSI2Q96DH6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSI2Q96DH6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSI2Q96DH6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1514.7 ms