Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TLCD1Q96CP7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TLCD1Q96CP7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TLCD1Q96CP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TLCD1Q96CP7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TLCD1Q96CP7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TLCD1Q96CP7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TLCD1Q96CP7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TLCD1Q96CP7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TLCD1Q96CP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TLCD1Q96CP7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TLCD1Q96CP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TLCD1Q96CP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TLCD1Q96CP7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TLCD1Q96CP7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TLCD1Q96CP7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TLCD1Q96CP7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TLCD1Q96CP7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TLCD1Q96CP7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TLCD1Q96CP7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TLCD1Q96CP7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TLCD1Q96CP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TLCD1Q96CP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TLCD1Q96CP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TLCD1Q96CP7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TLCD1Q96CP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TLCD1Q96CP7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TLCD1Q96CP7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TLCD1Q96CP7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TLCD1Q96CP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TLCD1Q96CP7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TLCD1Q96CP7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TLCD1Q96CP7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TLCD1Q96CP7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TLCD1Q96CP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TLCD1Q96CP7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TLCD1Q96CP7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TLCD1Q96CP7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TLCD1Q96CP7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TLCD1Q96CP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TLCD1Q96CP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TLCD1Q96CP7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TLCD1Q96CP7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLCD1Q96CP7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TLCD1Q96CP7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TLCD1Q96CP7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TLCD1Q96CP7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TLCD1Q96CP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TLCD1Q96CP7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLCD1Q96CP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLCD1Q96CP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLCD1Q96CP7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLCD1Q96CP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TLCD1Q96CP7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TLCD1Q96CP7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TLCD1Q96CP7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TLCD1Q96CP7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TLCD1Q96CP7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TLCD1Q96CP7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TLCD1Q96CP7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TLCD1Q96CP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TLCD1Q96CP7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TLCD1Q96CP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TLCD1Q96CP7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TLCD1Q96CP7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TLCD1Q96CP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TLCD1Q96CP7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TLCD1Q96CP7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TLCD1Q96CP7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TLCD1Q96CP7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TLCD1Q96CP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TLCD1Q96CP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TLCD1Q96CP7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TLCD1Q96CP7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TLCD1Q96CP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TLCD1Q96CP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms