Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP13Q92995 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP13Q92995 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP13Q92995 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP13Q92995 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP13Q92995 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP13Q92995 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP13Q92995 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP13Q92995 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP13Q92995 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP13Q92995 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP13Q92995 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP13Q92995 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP13Q92995 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP13Q92995 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP13Q92995 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP13Q92995 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP13Q92995 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP13Q92995 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
USP13Q92995 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP13Q92995 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP13Q92995 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP13Q92995 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP13Q92995 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP13Q92995 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP13Q92995 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP13Q92995 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP13Q92995 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP13Q92995 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP13Q92995 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP13Q92995 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP13Q92995 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP13Q92995 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP13Q92995 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP13Q92995 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP13Q92995 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP13Q92995 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP13Q92995 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP13Q92995 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP13Q92995 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP13Q92995 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP13Q92995 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
USP13Q92995 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP13Q92995 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP13Q92995 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP13Q92995 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP13Q92995 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP13Q92995 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP13Q92995 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP13Q92995 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP13Q92995 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP13Q92995 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
USP13Q92995 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP13Q92995 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP13Q92995 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP13Q92995 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP13Q92995 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP13Q92995 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP13Q92995 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP13Q92995 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP13Q92995 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP13Q92995 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP13Q92995 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP13Q92995 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP13Q92995 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP13Q92995 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP13Q92995 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP13Q92995 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP13Q92995 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP13Q92995 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP13Q92995 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP13Q92995 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP13Q92995 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP13Q92995 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP13Q92995 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP13Q92995 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP13Q92995 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP13Q92995 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP13Q92995 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP13Q92995 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP13Q92995 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP13Q92995 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP13Q92995 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP13Q92995 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP13Q92995 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP13Q92995 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP13Q92995 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP13Q92995 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP13Q92995 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP13Q92995 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP13Q92995 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP13Q92995 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP13Q92995 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP13Q92995 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP13Q92995 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP13Q92995 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP13Q92995 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP13Q92995 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP13Q92995 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP13Q92995 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms