Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCSTNQ92542 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCSTNQ92542 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCSTNQ92542 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCSTNQ92542 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCSTNQ92542 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCSTNQ92542 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCSTNQ92542 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCSTNQ92542 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCSTNQ92542 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCSTNQ92542 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCSTNQ92542 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCSTNQ92542 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCSTNQ92542 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCSTNQ92542 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCSTNQ92542 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCSTNQ92542 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCSTNQ92542 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCSTNQ92542 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NCSTNQ92542 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCSTNQ92542 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCSTNQ92542 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCSTNQ92542 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCSTNQ92542 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCSTNQ92542 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCSTNQ92542 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCSTNQ92542 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCSTNQ92542 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCSTNQ92542 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCSTNQ92542 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCSTNQ92542 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCSTNQ92542 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCSTNQ92542 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCSTNQ92542 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCSTNQ92542 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCSTNQ92542 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCSTNQ92542 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCSTNQ92542 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCSTNQ92542 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCSTNQ92542 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCSTNQ92542 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCSTNQ92542 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCSTNQ92542 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCSTNQ92542 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCSTNQ92542 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCSTNQ92542 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCSTNQ92542 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCSTNQ92542 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCSTNQ92542 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCSTNQ92542 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCSTNQ92542 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCSTNQ92542 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCSTNQ92542 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCSTNQ92542 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCSTNQ92542 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCSTNQ92542 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCSTNQ92542 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCSTNQ92542 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NCSTNQ92542 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCSTNQ92542 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCSTNQ92542 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCSTNQ92542 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCSTNQ92542 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms