Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SREK1Q8WXA9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREK1Q8WXA9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREK1Q8WXA9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SREK1Q8WXA9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SREK1Q8WXA9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SREK1Q8WXA9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SREK1Q8WXA9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SREK1Q8WXA9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SREK1Q8WXA9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SREK1Q8WXA9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SREK1Q8WXA9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREK1Q8WXA9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SREK1Q8WXA9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SREK1Q8WXA9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SREK1Q8WXA9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SREK1Q8WXA9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SREK1Q8WXA9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SREK1Q8WXA9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SREK1Q8WXA9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SREK1Q8WXA9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SREK1Q8WXA9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREK1Q8WXA9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SREK1Q8WXA9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREK1Q8WXA9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SREK1Q8WXA9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SREK1Q8WXA9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREK1Q8WXA9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREK1Q8WXA9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREK1Q8WXA9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SREK1Q8WXA9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SREK1Q8WXA9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SREK1Q8WXA9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SREK1Q8WXA9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SREK1Q8WXA9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SREK1Q8WXA9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SREK1Q8WXA9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREK1Q8WXA9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREK1Q8WXA9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREK1Q8WXA9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SREK1Q8WXA9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SREK1Q8WXA9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SREK1Q8WXA9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SREK1Q8WXA9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREK1Q8WXA9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SREK1Q8WXA9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SREK1Q8WXA9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms