Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW62

TMED6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED6Q8WW62 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMED6Q8WW62 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED6Q8WW62 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMED6Q8WW62 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED6Q8WW62 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED6Q8WW62 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED6Q8WW62 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED6Q8WW62 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED6Q8WW62 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED6Q8WW62 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED6Q8WW62 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED6Q8WW62 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED6Q8WW62 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED6Q8WW62 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED6Q8WW62 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED6Q8WW62 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED6Q8WW62 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED6Q8WW62 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED6Q8WW62 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED6Q8WW62 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED6Q8WW62 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED6Q8WW62 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED6Q8WW62 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED6Q8WW62 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED6Q8WW62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED6Q8WW62 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED6Q8WW62 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED6Q8WW62 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED6Q8WW62 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED6Q8WW62 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED6Q8WW62 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED6Q8WW62 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED6Q8WW62 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED6Q8WW62 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED6Q8WW62 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED6Q8WW62 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED6Q8WW62 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED6Q8WW62 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED6Q8WW62 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED6Q8WW62 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED6Q8WW62 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED6Q8WW62 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED6Q8WW62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED6Q8WW62 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED6Q8WW62 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED6Q8WW62 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED6Q8WW62 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED6Q8WW62 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED6Q8WW62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED6Q8WW62 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED6Q8WW62 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED6Q8WW62 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED6Q8WW62 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED6Q8WW62 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED6Q8WW62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms