Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTSF1Q8WW33 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTSF1Q8WW33 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTSF1Q8WW33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTSF1Q8WW33 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTSF1Q8WW33 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTSF1Q8WW33 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTSF1Q8WW33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTSF1Q8WW33 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTSF1Q8WW33 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTSF1Q8WW33 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTSF1Q8WW33 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTSF1Q8WW33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTSF1Q8WW33 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTSF1Q8WW33 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTSF1Q8WW33 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTSF1Q8WW33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTSF1Q8WW33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTSF1Q8WW33 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTSF1Q8WW33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTSF1Q8WW33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTSF1Q8WW33 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTSF1Q8WW33 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTSF1Q8WW33 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTSF1Q8WW33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTSF1Q8WW33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTSF1Q8WW33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTSF1Q8WW33 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTSF1Q8WW33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTSF1Q8WW33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTSF1Q8WW33 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTSF1Q8WW33 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTSF1Q8WW33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTSF1Q8WW33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTSF1Q8WW33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTSF1Q8WW33 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTSF1Q8WW33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTSF1Q8WW33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTSF1Q8WW33 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTSF1Q8WW33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTSF1Q8WW33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTSF1Q8WW33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTSF1Q8WW33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTSF1Q8WW33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTSF1Q8WW33 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTSF1Q8WW33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms