Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C15orf40Q8WUR7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C15orf40Q8WUR7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C15orf40Q8WUR7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C15orf40Q8WUR7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C15orf40Q8WUR7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C15orf40Q8WUR7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C15orf40Q8WUR7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf40Q8WUR7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf40Q8WUR7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf40Q8WUR7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf40Q8WUR7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf40Q8WUR7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf40Q8WUR7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf40Q8WUR7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf40Q8WUR7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf40Q8WUR7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C15orf40Q8WUR7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C15orf40Q8WUR7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C15orf40Q8WUR7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C15orf40Q8WUR7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C15orf40Q8WUR7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C15orf40Q8WUR7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C15orf40Q8WUR7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf40Q8WUR7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf40Q8WUR7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf40Q8WUR7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf40Q8WUR7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf40Q8WUR7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf40Q8WUR7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf40Q8WUR7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf40Q8WUR7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf40Q8WUR7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C15orf40Q8WUR7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf40Q8WUR7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf40Q8WUR7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C15orf40Q8WUR7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf40Q8WUR7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf40Q8WUR7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C15orf40Q8WUR7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C15orf40Q8WUR7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C15orf40Q8WUR7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C15orf40Q8WUR7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C15orf40Q8WUR7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C15orf40Q8WUR7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C15orf40Q8WUR7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C15orf40Q8WUR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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