Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER5

ARHGEF40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF40Q8TER5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ARHGEF40Q8TER5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
ARHGEF40Q8TER5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
ARHGEF40Q8TER5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
ARHGEF40Q8TER5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ARHGEF40Q8TER5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
ARHGEF40Q8TER5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
ARHGEF40Q8TER5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
ARHGEF40Q8TER5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
ARHGEF40Q8TER5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
ARHGEF40Q8TER5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
ARHGEF40Q8TER5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
ARHGEF40Q8TER5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARHGEF40Q8TER5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
ARHGEF40Q8TER5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
ARHGEF40Q8TER5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC44.78■■■■■ 4.76
ARHGEF40Q8TER5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
ARHGEF40Q8TER5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
ARHGEF40Q8TER5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ARHGEF40Q8TER5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
ARHGEF40Q8TER5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ARHGEF40Q8TER5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ARHGEF40Q8TER5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
ARHGEF40Q8TER5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ARHGEF40Q8TER5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ARHGEF40Q8TER5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ARHGEF40Q8TER5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ARHGEF40Q8TER5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ARHGEF40Q8TER5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ARHGEF40Q8TER5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ARHGEF40Q8TER5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ARHGEF40Q8TER5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ARHGEF40Q8TER5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
ARHGEF40Q8TER5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ARHGEF40Q8TER5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ARHGEF40Q8TER5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
ARHGEF40Q8TER5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ARHGEF40Q8TER5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ARHGEF40Q8TER5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ARHGEF40Q8TER5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ARHGEF40Q8TER5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ARHGEF40Q8TER5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ARHGEF40Q8TER5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ARHGEF40Q8TER5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ARHGEF40Q8TER5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
ARHGEF40Q8TER5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ARHGEF40Q8TER5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ARHGEF40Q8TER5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.63
ARHGEF40Q8TER5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARHGEF40Q8TER5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ARHGEF40Q8TER5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ARHGEF40Q8TER5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARHGEF40Q8TER5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ARHGEF40Q8TER5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ARHGEF40Q8TER5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
ARHGEF40Q8TER5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ARHGEF40Q8TER5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
ARHGEF40Q8TER5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ARHGEF40Q8TER5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ARHGEF40Q8TER5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
ARHGEF40Q8TER5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ARHGEF40Q8TER5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
ARHGEF40Q8TER5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ARHGEF40Q8TER5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
ARHGEF40Q8TER5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
ARHGEF40Q8TER5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
ARHGEF40Q8TER5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARHGEF40Q8TER5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
ARHGEF40Q8TER5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
ARHGEF40Q8TER5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
ARHGEF40Q8TER5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
ARHGEF40Q8TER5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ARHGEF40Q8TER5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF40Q8TER5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF40Q8TER5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ARHGEF40Q8TER5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ARHGEF40Q8TER5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ARHGEF40Q8TER5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
ARHGEF40Q8TER5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARHGEF40Q8TER5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARHGEF40Q8TER5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARHGEF40Q8TER5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ARHGEF40Q8TER5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
ARHGEF40Q8TER5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ARHGEF40Q8TER5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ARHGEF40Q8TER5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
ARHGEF40Q8TER5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ARHGEF40Q8TER5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
ARHGEF40Q8TER5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ARHGEF40Q8TER5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGEF40Q8TER5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGEF40Q8TER5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGEF40Q8TER5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
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