Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU6

PREX1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX1Q8TCU6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PREX1Q8TCU6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
PREX1Q8TCU6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
PREX1Q8TCU6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.66
PREX1Q8TCU6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
PREX1Q8TCU6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PREX1Q8TCU6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.01■■■■■ 4.64
PREX1Q8TCU6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44■■■■■ 4.63
PREX1Q8TCU6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PREX1Q8TCU6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PREX1Q8TCU6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
PREX1Q8TCU6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PREX1Q8TCU6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
PREX1Q8TCU6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
PREX1Q8TCU6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
PREX1Q8TCU6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
PREX1Q8TCU6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PREX1Q8TCU6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PREX1Q8TCU6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
PREX1Q8TCU6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PREX1Q8TCU6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PREX1Q8TCU6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PREX1Q8TCU6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
PREX1Q8TCU6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
PREX1Q8TCU6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PREX1Q8TCU6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
PREX1Q8TCU6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
PREX1Q8TCU6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PREX1Q8TCU6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PREX1Q8TCU6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
PREX1Q8TCU6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
PREX1Q8TCU6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PREX1Q8TCU6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PREX1Q8TCU6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
PREX1Q8TCU6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
PREX1Q8TCU6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
PREX1Q8TCU6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
PREX1Q8TCU6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
PREX1Q8TCU6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
PREX1Q8TCU6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
PREX1Q8TCU6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PREX1Q8TCU6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PREX1Q8TCU6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PREX1Q8TCU6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
PREX1Q8TCU6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PREX1Q8TCU6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PREX1Q8TCU6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
PREX1Q8TCU6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
PREX1Q8TCU6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
PREX1Q8TCU6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PREX1Q8TCU6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
PREX1Q8TCU6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
PREX1Q8TCU6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
PREX1Q8TCU6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
PREX1Q8TCU6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PREX1Q8TCU6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PREX1Q8TCU6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
PREX1Q8TCU6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PREX1Q8TCU6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PREX1Q8TCU6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
PREX1Q8TCU6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PREX1Q8TCU6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PREX1Q8TCU6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
PREX1Q8TCU6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
PREX1Q8TCU6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PREX1Q8TCU6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PREX1Q8TCU6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
PREX1Q8TCU6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
PREX1Q8TCU6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PREX1Q8TCU6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
PREX1Q8TCU6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
PREX1Q8TCU6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PREX1Q8TCU6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
PREX1Q8TCU6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
PREX1Q8TCU6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PREX1Q8TCU6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PREX1Q8TCU6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PREX1Q8TCU6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PREX1Q8TCU6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PREX1Q8TCU6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PREX1Q8TCU6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PREX1Q8TCU6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PREX1Q8TCU6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PREX1Q8TCU6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PREX1Q8TCU6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
PREX1Q8TCU6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PREX1Q8TCU6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PREX1Q8TCU6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
PREX1Q8TCU6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PREX1Q8TCU6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PREX1Q8TCU6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
PREX1Q8TCU6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PREX1Q8TCU6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms