Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBQ5

HSD17B11, Estradiol 17-beta-dehydrogenase 11, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B11Q8NBQ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSD17B11Q8NBQ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSD17B11Q8NBQ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSD17B11Q8NBQ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSD17B11Q8NBQ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSD17B11Q8NBQ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSD17B11Q8NBQ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSD17B11Q8NBQ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B11Q8NBQ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B11Q8NBQ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B11Q8NBQ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B11Q8NBQ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B11Q8NBQ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSD17B11Q8NBQ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSD17B11Q8NBQ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B11Q8NBQ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B11Q8NBQ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B11Q8NBQ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSD17B11Q8NBQ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B11Q8NBQ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSD17B11Q8NBQ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSD17B11Q8NBQ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HSD17B11Q8NBQ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HSD17B11Q8NBQ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSD17B11Q8NBQ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSD17B11Q8NBQ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSD17B11Q8NBQ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSD17B11Q8NBQ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSD17B11Q8NBQ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HSD17B11Q8NBQ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSD17B11Q8NBQ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSD17B11Q8NBQ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSD17B11Q8NBQ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSD17B11Q8NBQ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSD17B11Q8NBQ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSD17B11Q8NBQ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSD17B11Q8NBQ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSD17B11Q8NBQ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSD17B11Q8NBQ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSD17B11Q8NBQ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms