Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC71LQ8N9Z2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC71LQ8N9Z2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC71LQ8N9Z2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC71LQ8N9Z2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC71LQ8N9Z2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC71LQ8N9Z2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC71LQ8N9Z2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC71LQ8N9Z2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71LQ8N9Z2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC71LQ8N9Z2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71LQ8N9Z2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71LQ8N9Z2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC71LQ8N9Z2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC71LQ8N9Z2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71LQ8N9Z2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71LQ8N9Z2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC71LQ8N9Z2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC71LQ8N9Z2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC71LQ8N9Z2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC71LQ8N9Z2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC71LQ8N9Z2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC71LQ8N9Z2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71LQ8N9Z2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC71LQ8N9Z2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC71LQ8N9Z2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC71LQ8N9Z2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71LQ8N9Z2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71LQ8N9Z2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC71LQ8N9Z2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC71LQ8N9Z2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC71LQ8N9Z2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC71LQ8N9Z2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC71LQ8N9Z2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms