Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Q2

SREK1IP1, Protein SREK1IP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1IP1Q8N9Q2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1IP1Q8N9Q2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1IP1Q8N9Q2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1IP1Q8N9Q2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1IP1Q8N9Q2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREK1IP1Q8N9Q2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREK1IP1Q8N9Q2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREK1IP1Q8N9Q2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREK1IP1Q8N9Q2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1IP1Q8N9Q2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREK1IP1Q8N9Q2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREK1IP1Q8N9Q2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1IP1Q8N9Q2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREK1IP1Q8N9Q2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREK1IP1Q8N9Q2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREK1IP1Q8N9Q2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREK1IP1Q8N9Q2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREK1IP1Q8N9Q2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREK1IP1Q8N9Q2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREK1IP1Q8N9Q2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREK1IP1Q8N9Q2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREK1IP1Q8N9Q2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREK1IP1Q8N9Q2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SREK1IP1Q8N9Q2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SREK1IP1Q8N9Q2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SREK1IP1Q8N9Q2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SREK1IP1Q8N9Q2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SREK1IP1Q8N9Q2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREK1IP1Q8N9Q2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREK1IP1Q8N9Q2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREK1IP1Q8N9Q2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREK1IP1Q8N9Q2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREK1IP1Q8N9Q2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREK1IP1Q8N9Q2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREK1IP1Q8N9Q2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREK1IP1Q8N9Q2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREK1IP1Q8N9Q2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREK1IP1Q8N9Q2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREK1IP1Q8N9Q2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREK1IP1Q8N9Q2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREK1IP1Q8N9Q2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREK1IP1Q8N9Q2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1IP1Q8N9Q2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1IP1Q8N9Q2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SREK1IP1Q8N9Q2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1IP1Q8N9Q2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1IP1Q8N9Q2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1IP1Q8N9Q2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1IP1Q8N9Q2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1IP1Q8N9Q2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1IP1Q8N9Q2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1IP1Q8N9Q2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREK1IP1Q8N9Q2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREK1IP1Q8N9Q2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms